Le facteur B du complément participe, par l'un de ces fragments de clivage, à la formation du complexe C3b,Bb qui est la C3 convertase alterne. Le facteur B est également appelé C3 proactivateur.
Les déficits congénitaux en facteur B sont rares. Une diminution du facteur B peut s'observer lors de l'activation de la voie alterne et aussi de la voie classique par l'intermédiaire de la boucle d'amplification.
