La fraction C5 du complément appartient à la voie effectrice commune. Le C5 peut être clivé par les convertases des voies classique et alterne. L'assemblage du complexe terminal C5b-9 à la surface d'une bactérie ou d'une cellule est responsable d'une lésion de la membrane qui peut aboutir à la mort de la cellule cible.
Les déficits en C5 s'accompagnent d'une sensibilité accrue aux infections (notamment Nesseria) ; ils se rencontrent également dans certains syndromes lupiques.